Dans des mondes futurs, Atréides et Harkkonnen se disputent l'exploitation de l'épice sur Dune, planète hostile peuplée de Fremens et d'immenses vers attirés par les impulsions des moissonneuses. Alors que les cruels Harkonnen complotent avec l'empereur, Paul Atréides, le fils du duc Leto, semble être le messie attendu par les Fremens.

Dune est détruite, vitrifiée, atomisée. Avec ses habitants, ses temples et ses palais. Avec ses vers géants qui produisent l'Épice. Sur tout le vieil Empire déferlent les hordes furieuses des Honorées Matriarches, massacrant tout sur leur passage. Les planètes tombent l'une après l'autre. Seul le Bene Gesserit, dernière force encore debout, peut encore s'opposer à elles. Mais pour cela, il ne faut pas que la Planète du Chapitre, où le désert se propage déjà pour recréer un écosystème aux vers de sable et produire de nouveau de l'Épice, soit découverte. Darwi Odrade, la Mère Supérieure, a également un autre atout dans sa manche: Miles Teg, l'enfant ghola, issu d'un célèbre guerrier mais dont l' Éveil s'annonce délicat...